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溫室型高通量植物表型成像系統(tǒng)

簡要描述:溫室型高通量植物表型成像系統(tǒng)——PhenoAIxpert HT 是一套可以全自動、高通量對大量植株(從幼苗到成熟植株均可)進行成像的系統(tǒng),可以選擇配置可見光(VIS)成像、近紅外(NIR)成像、紅外(IR)成像、PSII 熒光成像、自發(fā)熒光成像、根系可見光成像、激光3D 掃描和高光譜成像等成像模塊,對植株進行表型分析。

  • 更新日期:2025-12-12
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詳細介紹

溫室型高通量植物表型成像系統(tǒng)——PhenoAIxpert HT 是一套可以全自動、高通量對大量植株(從幼苗到成熟植株均可)進行成像的系統(tǒng),可以選擇配置可見光(VIS)成像、近紅外(NIR)成像、紅外(IR)成像、PSII 熒光成像、自發(fā)熒光成像、根系可見光成像、激光3D 掃描和高光譜成像等成像模塊,對植株進行表型分析。

植物表型成像模塊:

可見光(VIS)成像模塊配有獨立的成像暗室,成像暗室內(nèi)分別設(shè)有頂部可見光成像單元和側(cè)面可見光成像單元。花盆底座有旋轉(zhuǎn)裝置,可以 360 度旋轉(zhuǎn),旋轉(zhuǎn)角度可通過軟件設(shè)置,獲取多個面的可見光表型參數(shù)。

葉綠素熒光成像模塊配有獨立的成像暗室,成像暗室內(nèi)分別設(shè)有頂部或側(cè)面葉綠素熒光成像單元。葉綠素熒光成像模塊配備暗適應(yīng) / 光適應(yīng)通道,用于測量葉綠素熒光時對植物的暗適應(yīng)和光誘導(dǎo)處理。葉綠素熒光成像模塊配備多種濾光鏡,實現(xiàn)多光譜熒光的測量功能?;ㄅ璧鬃行D(zhuǎn)裝置,可以 360 度旋轉(zhuǎn),旋轉(zhuǎn)角度可通過軟件設(shè)置,獲取多個面的葉綠素熒光表型參數(shù)。

紅外(IR)成像模塊為單獨頂部或單獨側(cè)面成像單元,如有必要,可配置頂部加側(cè)面雙成像單元,一般設(shè)在靠近栽培區(qū)的位置,且不配備成像暗室。當植物從栽培區(qū)域傳送到成像區(qū)域時,優(yōu)先時間可以獲取葉片溫度等參數(shù),極大地降低了由于在成像區(qū)域傳送時所造成的葉片溫度的變化所引起的誤差。如系統(tǒng)未配備栽培區(qū)傳送系統(tǒng),紅外成像模塊將被安裝在成像暗室中。

近紅外(NIR)成像模塊配備獨立暗室,具有頂部和側(cè)面兩個成像單元,成像單元配備自帶降溫系統(tǒng),確保設(shè)備處于合適的操作環(huán)境中。通過近紅外成像模塊可獲取植物水分分布數(shù)據(jù),與紅外成像模塊數(shù)據(jù)對應(yīng)可反映植物干旱情況,特別適合于植物干旱脅迫研究。

激光 3D 成像模塊是通過對植物進行 3D 掃描,獲取植物點云信息,重建植物 3D 構(gòu)型。LemnaTec 可將激光 3D 成像單元安裝在自動機械臂上,從而能夠圍繞植物進行 3D 掃描,獲取更精確的點云信息,使重建的 3D 構(gòu)型更加精確。

高光譜成像模塊提供 400-1700nm 的光譜成像,可以獲取植物內(nèi)在物質(zhì)的信息。高光譜成像模塊被安裝在自動機械臂上,可圍繞植物進行精確的高光譜成像,同時配備穩(wěn)定的鹵素光源,使高光譜成像數(shù)據(jù)更加精確。

自發(fā)熒光成像模塊可測量植物的自發(fā)熒光,用于植物衰老等研究。

根系可見光成像系統(tǒng)可以通過特殊角度的根盒,土壤原位培養(yǎng)植物,通過可見光成像系統(tǒng)拍攝根系圖像并進行分析。這也是德國 LemnaTec 專門為IPK 設(shè)計的根系測量系統(tǒng)。

溫室型高通量植物表型成像系統(tǒng)

自動傳送系統(tǒng)

自動傳送系統(tǒng)可將盆栽從栽培區(qū)傳送至各個成像模塊,成像完成后運送回栽培區(qū)?;跍y量樣品(包括花盆、培養(yǎng)基質(zhì)和植物)的重量不同,可配置帶式傳送系統(tǒng)和鏈式傳送系統(tǒng)。傳送系統(tǒng)通量根據(jù)需求和溫室大小而定,傳送系統(tǒng)承重 8-30kg 可選。當樣品由傳送系統(tǒng)在栽培區(qū)傳和成像區(qū)進行傳送時,兩個區(qū)域之間的氣動推拉門會自動打開,等樣品通過后自動關(guān)閉,確保兩個區(qū)域的溫度變化很小,互不干擾。自動傳送系統(tǒng)為模塊化設(shè)計,如有需求,后期可增加傳送通量。


所有傳送車上都有電子標簽,當傳送車通過加載區(qū)域(Loading area)時,系統(tǒng)會自動讀取電子標簽,所有成像數(shù)據(jù)根據(jù)電子標簽歸檔并存入本地數(shù)據(jù)庫。

自動澆水和稱重裝置

在溫室型高通量植物表型系統(tǒng)中,一般配備自動澆水和稱重裝置。通過軟件設(shè)置,可定時定量地對樣品進行澆水和稱重,且澆水量可精確控制。對于一些脅迫實驗,例如干旱脅迫實驗,精確地控制澆水量和精確地稱重尤為重要。


服務(wù)器存儲

由于植物表型數(shù)據(jù)量非常大,本系統(tǒng)配備服務(wù)器存儲數(shù)據(jù)。所有測量的表型數(shù)據(jù)均儲存在本地服務(wù)器上,數(shù)據(jù)安全,儲存環(huán)境穩(wěn)定。用戶分析數(shù)據(jù)時,系統(tǒng)自動從服務(wù)器調(diào)用源數(shù)據(jù),分析結(jié)果同樣儲存在本地服務(wù)器,安全穩(wěn)定。

軟件分析

LemnaTec 提供一套完備的軟件組用于控制硬件系統(tǒng)、獲取圖像數(shù)據(jù)、儲存數(shù)據(jù)和分析數(shù)據(jù),不同的功能由軟件組中不同的軟件來

實現(xiàn)。LemnaControl 用于控制整個硬件系統(tǒng),例如樣品傳送、成像單元設(shè)置、成像暗房光源設(shè)置、獲取圖片、自動澆水稱重等;

LemnaBase 提供數(shù)據(jù)庫基礎(chǔ)設(shè)施,用于存儲和訪問圖像;LemnaGrid 是綜合性的圖像分析工具箱;它可以建立不同算法的連接,

形成圖像處理直觀圖形化;LemnaMiner 進行基本數(shù)據(jù)分析,并具有所有標準格式的全面導(dǎo)出功能。

遠程管理

通過專用遠程服務(wù)器管理軟件,可以在異地對本系統(tǒng)的運轉(zhuǎn)狀況進行監(jiān)測、改變測量程序或分析測量數(shù)據(jù)。

主要功能

可全自動、高通量對植物樣品進行可見光(VIS)成像、近紅外(NIR)成像、紅外(IR)成像、PSII 熒光成像、自發(fā)熒光成像、根系可見光成像、激光 3D 掃描和高光譜成像等

可見光成像可以測量植物的結(jié)構(gòu)、寬度、密度、對稱性、葉長、葉寬、葉面積、葉角度、葉顏色、葉病斑分析等多個參數(shù)

葉綠素熒光成像可以分析植物的生理狀態(tài),例如 Fo、Fm、Fi、Fm’、Fi’、Fs’、Fo、Fm、Fv/ Fm、?Ro=(Fm-Fi)/Fm、 ?PSII=?、Pt=Fq’ /Fm’ =(Fm’ -Fs’ )/Fm’、 ETR 、 NPQ 等參數(shù),此外葉綠素熒光成像單元標配搭載濾光輪,可實現(xiàn)多光譜熒光成像,獲取RAnth、RChl.、 RNIR、 RRed、 RGreen、 RBlue 等數(shù)據(jù)

紅外成像可以測量植物葉片表面溫度,進行植物干旱脅迫研究、蒸騰研究等

近紅外成像可測量植物水分分布,用于研究植物水分分布,適合干旱脅迫研究等

高光譜成像可以比較植物體內(nèi)特殊物質(zhì)的變化,例如葉黃素、葉綠素等色素的反射峰值、葉片組織構(gòu)造如海綿組織的反射率、葉片的含水量、葉片生化組分、主要植被指數(shù)(NDVI、RVI、GVI 等)

3D 激光成像可獲取植物 3D 點云數(shù)據(jù),用于對植物體的三維重構(gòu),以更精確地研究植物株型變化

自發(fā)熒光成像模塊可測量植物自發(fā)熒光,用于衰老實驗的測量

根系可見光成像可研究根系的不同參數(shù)

代表文獻

Lobiuc, A.; Vasilache, V.; Oroian, M.; Stoleru, T.; Burducea, M.; Pintilie, O.; Zamfirache, M.-M. (2017) Blue and Red LED Illumination Improves Growth and Bioactive Compounds Contents in Acyanic and Cyanic Ocimum basilicum L. Microgreens. Molecules

Brugière, Norbert; Zhang, Wenjing; Xu, Qingzhang; Scolaro, Eric J.; Lu, Cheng; Kahsay, Robel Y.; Kise, Rie; Trecker, Libby; Williams, Robert W.; Hakimi, Salim; Niu, Xiping; Lafitte, Renee; Habben, Jeffrey E. (2017) Overexpression of RING Domain E3 Ligase ZmXerico1 Confers Drought Tolerance through Regulation of ABA Homeostasis. Plant Physiology

D. Marko; N. Briglia; S. Summerer; A. Petrozza; F. Cellini; R. Iannacone (2017) High-Throughput Phenotyping in Plant Stress Response: Methods and Potential Applications to Polyamine Field. Polyamines

Velumani, K.; Oude Elberink, S.; Yang, M. Y.; BARET, F. (2017) Wheat Ear Detection in Plots by Segmenting Mobile Laser Scanner Data. ISPRS Ann. Photogramm. Remote Sens. Spatial Inf. Sci.

Maria I. Stavropoulou, Apostolis Angelis, Nektarios Aligiannis, Eleftherios Kalpoutzakis, Sofia Mitakou, Stephen O. Duke, Nikolas Fokialakis (2017) Phytotoxic triterpene saponins from Bellis longifolia, an endemic plant of Crete. Phytochemistry

Srinivasan Vijayarangan, Paloma Sodhi, Prathamesh Kini, James Bourne, Simon Du, Hanqi Sun, Barnabas Poczos, Dimitrios Apostolopoulos, and David Wettergreen (2017) High-throughput Robotic Phenotyping of Energy Sorghum Crops. Field and Service Robotics.

Coneva, Viktoriya; Frank, Margaret H.; Balaguer, Maria A. de Luis; Li, Mao; Sozzani, Rosangela; Chitwood, Daniel H. (2017) Genetic Architecture and Molecular Networks Underlying Leaf Thickness in Desert-Adapted Tomato Solanum pennellii. Plant Physiology

溫室型高通量植物表型成像系統(tǒng)  產(chǎn)地: 德國LemnaTec

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